293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2811 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 292 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  60.25 
 
 		 162 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  51.53 
 
 		 167 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 170 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 163 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  52.47 
 
 		 165 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  51.9 
 
 		 166 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 178 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 170 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  48.75 
 
 		 166 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  50.91 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  49.07 
 
 		 167 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 167 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  49.4 
 
 		 178 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  53.42 
 
 		 165 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  51.52 
 
 		 166 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 169 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 167 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 179 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 		 171 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  48.82 
 
 		 187 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 166 aa  142  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 167 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 179 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 161 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 161 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  48.72 
 
 		 163 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 162 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 160 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 167 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 164 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 167 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 167 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 167 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 177 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 167 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  41.14 
 
 		 162 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 183 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 167 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 164 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 172 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 164 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 161 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 219 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  51.28 
 
 		 166 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 166 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  43.53 
 
 		 171 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 171 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 172 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 167 aa  135  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 167 aa  135  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  50.64 
 
 		 166 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 173 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  49.32 
 
 		 174 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 169 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2048  dihydrofolate reductase  52.9 
 
 		 164 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 177 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 172 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 166 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 160 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  40.25 
 
 		 161 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 		 160 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  47.47 
 
 		 166 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 160 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 160 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 166 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 163 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 		 160 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  41.14 
 
 		 160 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  42.01 
 
 		 171 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 160 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  46.51 
 
 		 195 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 163 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  43.37 
 
 		 167 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  53.44 
 
 		 163 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 160 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  46.5 
 
 		 160 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 170 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 162 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0767  transporter  54.76 
 
 		 131 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0100171  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 169 aa  129  6e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 160 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 		 160 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 160 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 180 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 		 337 aa  128  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  44.79 
 
 		 172 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  43.59 
 
 		 162 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  41.92 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 167 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 162 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  42.38 
 
 		 160 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  47.24 
 
 		 159 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 170 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  47.67 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 164 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 		 160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>