65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2745 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2745  HNH endonuclease  100 
 
 
149 aa  296  9e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00704731  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4428  hypothetical protein  46.36 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.580751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1061  HNH endonuclease  47.62 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255023  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3731  HNH endonuclease  51.09 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1015  HNH endonuclease  48.53 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  38.58 
 
 
177 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  38.1 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0450  HNH endonuclease  38.82 
 
 
390 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.480855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  38.37 
 
 
388 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  38.82 
 
 
388 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  38.82 
 
 
316 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  37.65 
 
 
391 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  38.37 
 
 
390 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  36.14 
 
 
391 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  37.21 
 
 
391 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  37.65 
 
 
388 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  37.21 
 
 
388 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  37.65 
 
 
388 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  37.21 
 
 
264 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  37.65 
 
 
461 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  36.47 
 
 
362 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  38.61 
 
 
186 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  37.65 
 
 
390 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  36.47 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  35.17 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  36.25 
 
 
309 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  41.33 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  50 
 
 
240 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  35.35 
 
 
387 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  38.89 
 
 
360 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  44.83 
 
 
368 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  41.33 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  38.16 
 
 
356 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  33.06 
 
 
560 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  33.33 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  37.68 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  43.1 
 
 
368 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  32.62 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  36.76 
 
 
363 aa  45.1  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  38.98 
 
 
357 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  38.98 
 
 
379 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  41.07 
 
 
362 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  41.07 
 
 
361 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  43.1 
 
 
370 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  43.1 
 
 
373 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  34.21 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  29.77 
 
 
321 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  35.48 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  36.05 
 
 
370 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  43.1 
 
 
362 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  39.66 
 
 
370 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  41.07 
 
 
355 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  41.07 
 
 
179 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  41.38 
 
 
416 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  41.07 
 
 
386 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  31.58 
 
 
359 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  54.84 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  34.33 
 
 
336 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  36.62 
 
 
585 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  33.06 
 
 
372 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  31.17 
 
 
464 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  34.33 
 
 
355 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  50 
 
 
594 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  39.29 
 
 
384 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  39.29 
 
 
358 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>