131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2652 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 154 aa  289  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  70.39 
 
 		 177 aa  203  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  70.39 
 
 		 177 aa  203  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  70.39 
 
 		 177 aa  203  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  67.11 
 
 		 160 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  62.09 
 
 		 161 aa  183  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  57.62 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  52.98 
 
 		 186 aa  160  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  53.29 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  52.32 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  51.33 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  52 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  54 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  45.03 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  47.37 
 
 		 195 aa  127  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  45.33 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  49.24 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  48 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  48 
 
 		 196 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  41.45 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  37.75 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  40.13 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  32.92 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  31.25 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  30.52 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  31.01 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  34.62 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  34.39 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  28.48 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  28.48 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  28.48 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  28.48 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  28.48 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  28.48 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  28.57 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  28.57 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  28.57 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  28.57 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  29.87 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  28.57 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  34.19 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  27.86 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  27.86 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  33.55 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  28.39 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  54.24 
 
 		 662 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 		 674 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  39.47 
 
 		 656 aa  57.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  36.55 
 
 		 720 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  26.8 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.91 
 
 		 697 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 		 672 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  47.62 
 
 		 671 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  37.84 
 
 		 350 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  33.71 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  42.19 
 
 		 664 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.63 
 
 		 671 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  25.52 
 
 		 336 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  30 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  39.13 
 
 		 673 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  34.78 
 
 		 233 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 		 665 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  32.95 
 
 		 636 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.77 
 
 		 663 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  36.07 
 
 		 227 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 		 666 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  29.85 
 
 		 401 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  37.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  37.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  37.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  37.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  37.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.32 
 
 		 371 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  37.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  37.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  37.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  37.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 214 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  37.68 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  32.14 
 
 		 762 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  36.92 
 
 		 356 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  44.3  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  39.71 
 
 		 710 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  36.92 
 
 		 356 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  48.08 
 
 		 564 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  36.23 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>