More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2635 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  66.82 
 
 		 218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.82 
 
 		 220 aa  272  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.73 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.08 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  65.88 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.65 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  60.73 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.21 
 
 		 191 aa  238  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 213 aa  194  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 232 aa  159  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  38.21 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  42.66 
 
 		 234 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.02 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  42.86 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  36.54 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  36.54 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  36.11 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.35 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 303 aa  148  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  36.7 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.89 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  36.62 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.02 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.47 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  35.05 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 213 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  40.53 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  37.2 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  39.73 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2253  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.79 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.55 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  36.19 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>