More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2608 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  100 
 
 
380 aa  758    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  53.87 
 
 
355 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  53.87 
 
 
355 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  53.87 
 
 
355 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  55.23 
 
 
360 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  52.56 
 
 
365 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  54.7 
 
 
365 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  54.36 
 
 
353 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  49 
 
 
356 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  49 
 
 
356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  52.68 
 
 
376 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  53.12 
 
 
363 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  48.69 
 
 
344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  50.59 
 
 
369 aa  328  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  49.86 
 
 
360 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  46.99 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  49.44 
 
 
356 aa  318  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  47.55 
 
 
363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  49.72 
 
 
367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  46.76 
 
 
360 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  43.85 
 
 
366 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  35.8 
 
 
357 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  35.5 
 
 
357 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  35.67 
 
 
353 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  36.48 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  35.95 
 
 
349 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
351 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  32.93 
 
 
357 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  35.82 
 
 
357 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  33.13 
 
 
359 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  33.88 
 
 
360 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  32.68 
 
 
351 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  30.65 
 
 
353 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  34.6 
 
 
360 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  33.24 
 
 
358 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
353 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  33.33 
 
 
348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
357 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  30.06 
 
 
353 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  29.97 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
363 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
348 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  32.12 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  31.64 
 
 
348 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  30.92 
 
 
416 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  30.92 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  31.64 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  31.04 
 
 
351 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 
356 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  30.36 
 
 
351 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  33.42 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  34.56 
 
 
355 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  31 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  36.46 
 
 
263 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
264 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.03 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2117  protein of unknown function DUF938  35.83 
 
 
199 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.143644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
258 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
439 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  26.8 
 
 
269 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
268 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  28.85 
 
 
205 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
263 aa  56.2  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
263 aa  56.2  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
263 aa  56.2  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
252 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 
252 aa  56.2  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.08 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.37 
 
 
447 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
226 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
246 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  26.47 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.08 
 
 
258 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.69 
 
 
213 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
256 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.89 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  39.44 
 
 
535 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.58 
 
 
256 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
211 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
262 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.11 
 
 
258 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.61 
 
 
346 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
274 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
402 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  25.88 
 
 
269 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
272 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  32.41 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  29.52 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  27.46 
 
 
267 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
234 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
250 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30 
 
 
202 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  34.38 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>