More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2591 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  773    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  71.1 
 
 
391 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  48.59 
 
 
394 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  46.54 
 
 
388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  41.69 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  43.14 
 
 
400 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  41.53 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  41.16 
 
 
399 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  41.09 
 
 
398 aa  232  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  37.63 
 
 
390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  40.6 
 
 
402 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  36.15 
 
 
402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  39.6 
 
 
374 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  38.36 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  37.94 
 
 
377 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  37.43 
 
 
372 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  40.36 
 
 
387 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  38.75 
 
 
424 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  37.64 
 
 
396 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  35.1 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  35.2 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  39.24 
 
 
393 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  34.9 
 
 
396 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  36.83 
 
 
400 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  34.76 
 
 
415 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  33.79 
 
 
380 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  35.26 
 
 
402 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.39 
 
 
403 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 
371 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  36.56 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  36.56 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  34.69 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  30.16 
 
 
372 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  34.28 
 
 
418 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  36.84 
 
 
397 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  35 
 
 
403 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  32 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  32.5 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  34.25 
 
 
388 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  35.68 
 
 
393 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  33.07 
 
 
388 aa  163  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  32.99 
 
 
388 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  38.41 
 
 
393 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  36.04 
 
 
381 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  34.85 
 
 
396 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  37.96 
 
 
411 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  31.55 
 
 
467 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  31.46 
 
 
398 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  34.93 
 
 
496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
400 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  34.46 
 
 
386 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.05 
 
 
387 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  30.05 
 
 
405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  32.88 
 
 
423 aa  143  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  33.05 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  33.78 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  33.42 
 
 
395 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  33.7 
 
 
392 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  30.69 
 
 
351 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  29.83 
 
 
373 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  30.53 
 
 
411 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.33 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.74 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.21 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  28.46 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.03 
 
 
404 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  28.02 
 
 
376 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.86 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  29.95 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.91 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.53 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.49 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  29.02 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.24 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  29.13 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.63 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  27.13 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  27.13 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  29.57 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  21.57 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  27.3 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.91 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  29.94 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  27.14 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.03 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.59 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  27.17 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  27.71 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  26.74 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  26.33 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  26.45 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.57 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  30.14 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  30.14 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  26.96 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.61 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>