More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2454 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  100 
 
 
587 aa  1147    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  58.91 
 
 
560 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  55.25 
 
 
575 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  52.81 
 
 
574 aa  555  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  50.8 
 
 
565 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  57.22 
 
 
566 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  55.8 
 
 
559 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  39.54 
 
 
580 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  41.29 
 
 
575 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  38.5 
 
 
576 aa  363  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  38.49 
 
 
578 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  39.02 
 
 
573 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  39.86 
 
 
583 aa  357  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  39 
 
 
590 aa  349  9e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  40.71 
 
 
592 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  36.35 
 
 
568 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  38.31 
 
 
573 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  36.35 
 
 
568 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  40.18 
 
 
590 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  36.17 
 
 
568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  37.32 
 
 
596 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  41.73 
 
 
556 aa  334  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  38.8 
 
 
570 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  38.14 
 
 
579 aa  333  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  37.37 
 
 
595 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  38 
 
 
570 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  38 
 
 
570 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  38.05 
 
 
586 aa  326  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  36.64 
 
 
582 aa  320  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  38.13 
 
 
585 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  34.5 
 
 
585 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  36.08 
 
 
576 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  34.33 
 
 
585 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  34.33 
 
 
585 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  34.33 
 
 
585 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  34.33 
 
 
585 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  33.33 
 
 
591 aa  301  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  36.38 
 
 
600 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  34.79 
 
 
585 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  34.97 
 
 
585 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  34.97 
 
 
585 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  34.44 
 
 
590 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  35.33 
 
 
567 aa  294  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  37.11 
 
 
610 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.11 
 
 
610 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.11 
 
 
610 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.11 
 
 
610 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  38.11 
 
 
563 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  36.71 
 
 
605 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  37.24 
 
 
572 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.94 
 
 
610 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.94 
 
 
610 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  36.94 
 
 
610 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  35.14 
 
 
592 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  37.7 
 
 
576 aa  284  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  35.08 
 
 
574 aa  282  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  34.03 
 
 
578 aa  281  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  34.8 
 
 
579 aa  280  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  31.99 
 
 
569 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  34.8 
 
 
579 aa  280  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  35.06 
 
 
592 aa  280  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  31.99 
 
 
569 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  40.87 
 
 
569 aa  279  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  36.55 
 
 
571 aa  274  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  31.88 
 
 
574 aa  273  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  35.32 
 
 
569 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  31.6 
 
 
584 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  39.07 
 
 
581 aa  266  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  36.62 
 
 
565 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  32.36 
 
 
572 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  29.95 
 
 
571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  33.52 
 
 
575 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  33.63 
 
 
585 aa  250  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  32.38 
 
 
588 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  36.23 
 
 
591 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  33.33 
 
 
576 aa  247  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  31.4 
 
 
578 aa  247  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  36.14 
 
 
565 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  36.26 
 
 
558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  34.09 
 
 
586 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  33.83 
 
 
557 aa  240  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  35.91 
 
 
573 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  33.9 
 
 
570 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  31.47 
 
 
566 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  31.79 
 
 
588 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  31.33 
 
 
567 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  33.46 
 
 
583 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  29.4 
 
 
588 aa  233  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  35.11 
 
 
590 aa  232  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  32.1 
 
 
576 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  32.91 
 
 
583 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  34.04 
 
 
570 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  36.19 
 
 
570 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4477  sulphate transporter  34.32 
 
 
624 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.496082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4576  sulphate transporter  35.35 
 
 
572 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5729  sulphate transporter  35.35 
 
 
572 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.46333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  34.93 
 
 
558 aa  224  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3792  sulphate transporter  35.35 
 
 
619 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  34.24 
 
 
585 aa  224  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1268  sulphate transporter  35.16 
 
 
658 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0855544  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>