More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2428 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  100 
 
 
318 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  48.75 
 
 
320 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  45.48 
 
 
329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  44.21 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  45.39 
 
 
342 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  48.87 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  42.86 
 
 
311 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  45.51 
 
 
323 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  41.72 
 
 
315 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  43.52 
 
 
314 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  44.59 
 
 
321 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  42 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  39.55 
 
 
327 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  39.93 
 
 
317 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  43.07 
 
 
319 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  45.86 
 
 
321 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  39.39 
 
 
314 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  40.79 
 
 
327 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 
330 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  40.13 
 
 
330 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 
330 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  39.94 
 
 
330 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.46 
 
 
291 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  38.89 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 
330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  38.14 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  39.54 
 
 
328 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  39.41 
 
 
316 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  38.44 
 
 
320 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  39.14 
 
 
314 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  38.46 
 
 
316 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  39.74 
 
 
329 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  39.73 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  35.87 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  38.76 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  37.5 
 
 
306 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  38.96 
 
 
329 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  40.62 
 
 
324 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  39.93 
 
 
316 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  29.58 
 
 
313 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.09 
 
 
329 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  40.15 
 
 
316 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  38.39 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.39 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  42.35 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  38.11 
 
 
329 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  38.83 
 
 
329 aa  139  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  40.73 
 
 
318 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.79 
 
 
329 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  37.21 
 
 
317 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  41.42 
 
 
363 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  37.83 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  37.23 
 
 
316 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.82 
 
 
320 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  33.99 
 
 
312 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  36.33 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  34.94 
 
 
320 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  33.6 
 
 
317 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.09 
 
 
318 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  34.52 
 
 
320 aa  123  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  38.36 
 
 
319 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  40.29 
 
 
320 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.08 
 
 
325 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  32.25 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  38.27 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  37.14 
 
 
318 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  34.39 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  33.2 
 
 
308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  36.33 
 
 
308 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 
308 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  34.96 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  34.55 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  34.55 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.31 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.92 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  36.89 
 
 
308 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30.18 
 
 
320 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  30.63 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  33.97 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  32.83 
 
 
347 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  32.66 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.74 
 
 
326 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  34.52 
 
 
332 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2162  PfkB domain protein  35.06 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0183703  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  31.18 
 
 
313 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  30.18 
 
 
342 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  37.25 
 
 
308 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  31.62 
 
 
312 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.41 
 
 
320 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  32.79 
 
 
321 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  34.51 
 
 
310 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  27.38 
 
 
340 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.6 
 
 
298 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  32.73 
 
 
298 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  36.93 
 
 
308 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>