86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2374 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  100 
 
 
566 aa  1164    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  42.83 
 
 
513 aa  344  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  37.78 
 
 
480 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  35.24 
 
 
1024 aa  206  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  33.74 
 
 
1096 aa  171  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  33.99 
 
 
1028 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  32.68 
 
 
735 aa  164  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0709  hypothetical protein  31.54 
 
 
733 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247349  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  30.3 
 
 
1004 aa  153  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2456  secreted metalloprotease  27.31 
 
 
543 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.055863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  29.29 
 
 
1076 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  31.14 
 
 
998 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  29.8 
 
 
994 aa  122  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  31.37 
 
 
1825 aa  120  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40744  predicted protein  27.48 
 
 
583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49918  predicted protein  25.86 
 
 
652 aa  103  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  35.78 
 
 
927 aa  103  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  31.75 
 
 
918 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  32.84 
 
 
936 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  33.09 
 
 
936 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  32.34 
 
 
856 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  32.34 
 
 
799 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  33.47 
 
 
781 aa  93.6  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  31.54 
 
 
951 aa  93.6  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  32.34 
 
 
799 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  32.34 
 
 
799 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  32.34 
 
 
799 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  32.67 
 
 
796 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  31.14 
 
 
951 aa  93.2  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  32.34 
 
 
799 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  32.34 
 
 
799 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  32.34 
 
 
799 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  32.34 
 
 
799 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  32.34 
 
 
799 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  29.87 
 
 
935 aa  91.3  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  32.33 
 
 
794 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  32.1 
 
 
812 aa  90.5  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.02 
 
 
795 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.94 
 
 
795 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  32.33 
 
 
794 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  31 
 
 
795 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  31 
 
 
795 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  32.33 
 
 
795 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.23 
 
 
796 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  29.02 
 
 
869 aa  87.8  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  31.23 
 
 
796 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  31.75 
 
 
965 aa  87.4  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  31.23 
 
 
796 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  32.81 
 
 
795 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  27.2 
 
 
778 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  30.49 
 
 
795 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  28.57 
 
 
746 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  31.35 
 
 
795 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  31.35 
 
 
795 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.35 
 
 
795 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  31.35 
 
 
795 aa  84  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  32.27 
 
 
865 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  28.24 
 
 
867 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  29.02 
 
 
865 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  27.93 
 
 
763 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  29.88 
 
 
945 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  31.48 
 
 
751 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  29.41 
 
 
871 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  26.6 
 
 
764 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  29.82 
 
 
938 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  26.51 
 
 
763 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  30.41 
 
 
924 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  28.46 
 
 
938 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  31.07 
 
 
771 aa  78.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.09 
 
 
1045 aa  76.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  28.52 
 
 
871 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  25.59 
 
 
885 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  25.49 
 
 
770 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0132  hypothetical protein  28.9 
 
 
881 aa  74.7  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  25.54 
 
 
811 aa  74.3  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.92 
 
 
744 aa  67  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  29.33 
 
 
760 aa  67  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.03 
 
 
747 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  25.14 
 
 
1406 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  27.48 
 
 
768 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  24.22 
 
 
825 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0647  hypothetical protein  24.44 
 
 
915 aa  54.7  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.449731  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2455  hypothetical protein  23.92 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000334533  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  25.14 
 
 
811 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  25.12 
 
 
1367 aa  47.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  25.81 
 
 
806 aa  43.5  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>