More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2354 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 324 aa  641    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  65.92 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  54.33 
 
 		 620 aa  278  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.49 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.84 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  34.21 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2273  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.07 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.66 
 
 		 378 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  28.16 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18600  MoxR-like ATPase  30.94 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191863  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.82 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  29.41 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0240  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.54 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.288695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.66 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  30.15 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  32.61 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  32.61 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.28 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.84 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  32.47 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.64 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.07 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.56 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  30.46 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  32.65 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  27.65 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.93 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  30 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  31.71 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.25 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  32.05 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  30.7 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.76 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  30.5 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  32.04 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.93 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  30.93 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  33.33 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  31.25 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  30.21 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  30.21 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  32.98 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  30.65 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  28.15 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  31.22 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  29.02 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  33.15 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.15 
 
 		 380 aa  79  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.96 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2146  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.88 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  29.63 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  29.02 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  30.27 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  23.93 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.89 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  28.66 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  29.43 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  29.38 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  26.32 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.88 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  29.02 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  29.02 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  27.14 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  31.3 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  25.79 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  31.95 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  29.02 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.94 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.38 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  30.29 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.86 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  29.02 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.69 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  33.51 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.1 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  28.26 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  29.74 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  30.41 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  28.26 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.07 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.38 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.93 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  28.26 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  28.26 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  28.26 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  28.86 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  33.16 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  28.26 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  28.26 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  23.95 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  28.26 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  28.63 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  30.49 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0845  ATPase  30.56 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.418031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  31.16 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  29.73 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  29.3 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.28 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  32.28 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.12 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0680524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>