More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2280 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 		 167 aa  343  8.999999999999999e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  72.03 
 
 		 153 aa  220  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  68.28 
 
 		 151 aa  220  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  72.03 
 
 		 153 aa  220  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  72.03 
 
 		 153 aa  220  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  66.44 
 
 		 151 aa  207  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  62.76 
 
 		 151 aa  206  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  64.34 
 
 		 155 aa  204  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  64.34 
 
 		 153 aa  203  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  65.96 
 
 		 147 aa  201  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  65.03 
 
 		 162 aa  201  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  63.4 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  61.29 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  62.76 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  62.91 
 
 		 150 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  59.33 
 
 		 160 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  62.24 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  57.5 
 
 		 157 aa  192  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  61.27 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  58.74 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  58.33 
 
 		 163 aa  183  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  58.57 
 
 		 163 aa  181  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  58.45 
 
 		 155 aa  177  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  57.86 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  56.76 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3078  NifU family SUF system FeS assembly protein  58.78 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167444  normal  0.201859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  55.94 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  51.05 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  50 
 
 		 155 aa  150  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  46.54 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.66 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1676  SUF system FeS assembly protein, NifU family  47.77 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  46.31 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.5 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2335  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.24 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610109  normal  0.712132 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  45.71 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0602  hypothetical protein  36.78 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.547374  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  37.59 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  39.01 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.52 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.820137 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.62 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.62 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  40.26 
 
 		 163 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.15 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.13 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.15 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.96 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  36.17 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  38.19 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.19 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.19 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  41.29 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.29 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.29 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  41.29 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  41.29 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  41.29 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.73 
 
 		 137 aa  99.8  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.71 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.29 
 
 		 163 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  38.46 
 
 		 140 aa  97.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.88 
 
 		 151 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.46 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  34.72 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  38.3 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.32 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.8 
 
 		 139 aa  95.5  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.55 
 
 		 154 aa  95.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.66 
 
 		 141 aa  94.7  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.59 
 
 		 149 aa  94  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  38.03 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  38.03 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  34.23 
 
 		 146 aa  92.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  35.71 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35 
 
 		 148 aa  90.9  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.72 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.32 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  36.36 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.33 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.88 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.62 
 
 		 151 aa  84.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.04 
 
 		 138 aa  84.3  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.04 
 
 		 138 aa  84.3  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  34.44 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  33.8 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  33.8 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  33.8 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  33.8 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  33.8 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  33.8 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.21 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  33.8 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  33.8 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.8 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  32.39 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  33.8 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.22 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.78 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  29.17 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>