46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2274 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  996    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  41.65 
 
 		 543 aa  359  9e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  40.43 
 
 		 594 aa  329  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  39.42 
 
 		 551 aa  319  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  38.74 
 
 		 579 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  38.74 
 
 		 579 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  38.74 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  43.7 
 
 		 527 aa  313  6.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  38.71 
 
 		 607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  39.44 
 
 		 572 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  37.59 
 
 		 591 aa  289  9e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  40.92 
 
 		 539 aa  249  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  37.41 
 
 		 557 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  34.63 
 
 		 529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  35.9 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  34.1 
 
 		 527 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  40.15 
 
 		 486 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  34.21 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.55 
 
 		 505 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  35.44 
 
 		 510 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  35.44 
 
 		 510 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  35.44 
 
 		 510 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  33.99 
 
 		 518 aa  176  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  35.18 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  33.42 
 
 		 508 aa  170  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  37.16 
 
 		 519 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  34.66 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  33.49 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  33.59 
 
 		 490 aa  156  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  33.51 
 
 		 563 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  36.22 
 
 		 472 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  32.04 
 
 		 575 aa  121  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  35.57 
 
 		 522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  32.09 
 
 		 509 aa  97.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  28.17 
 
 		 592 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  30.54 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  34.72 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  30.64 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  45.31 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  25.3 
 
 		 477 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1899  hypothetical protein  22.93 
 
 		 468 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1679  hypothetical protein  25.73 
 
 		 517 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  33.81 
 
 		 519 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  26.61 
 
 		 477 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0171  hypothetical protein  31.33 
 
 		 473 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  28.99 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>