88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2268 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 337 aa  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  45.62 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  44.22 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  49.43 
 
 		 342 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  48.3 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  47.92 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  46.67 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  44.52 
 
 		 351 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  44.67 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  39.2 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  40.75 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  45.09 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  43.25 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  44.82 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  41.33 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  47.5 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  44.83 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  42.14 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  42.96 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  42.27 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  36.45 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  42.91 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  40.14 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  42.3 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  42.91 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  41.97 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  40.78 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  41.95 
 
 		 351 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  40.6 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  39.15 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  40.13 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  38.85 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  36.39 
 
 		 320 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.49 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  35 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  35.74 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  34.17 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.68 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  38.25 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  28.34 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  28.34 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  26.53 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  32.52 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.18 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  32.99 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  31.43 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  31.43 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  24.92 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  26.52 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  32.99 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  27.03 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  31.03 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  31.03 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  34.38 
 
 		 361 aa  53.1  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 		 304 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  23.83 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  41.74 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  30.94 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  29.93 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  35.11 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  33.69 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  34.94 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  26.58 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  39.29 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  36.54 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  34.4 
 
 		 622 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  35.11 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  24.3 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  24.85 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  43.75 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  31.45 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  27.54 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  43.75 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  43.08 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  33.87 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  26.38 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  38.1 
 
 		 624 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  41.43 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  30.51 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  30.91 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  28.29 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  27.81 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  40 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  33.33 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  28.89 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  28.68 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  30.65 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>