173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2252 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2252  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 607 aa  1221    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000542956  normal  0.119281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1436  TrkA-N domain protein  61.62 
 
 		 614 aa  697    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  41.31 
 
 		 563 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2004  TrkA-N domain protein  42.68 
 
 		 579 aa  442  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.88767  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  39.25 
 
 		 564 aa  438  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  41.06 
 
 		 575 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  40.25 
 
 		 583 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  38.85 
 
 		 564 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  40.22 
 
 		 546 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03220  K+ transport system, NAD-binding component  37.26 
 
 		 650 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  36.01 
 
 		 564 aa  346  6e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  29 
 
 		 562 aa  299  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.39 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.49 
 
 		 347 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  28.97 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  24.18 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.5 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  25.41 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  25.35 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  22.44 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  22.96 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25.12 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.09 
 
 		 354 aa  72.8  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  25.71 
 
 		 352 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  26.82 
 
 		 356 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  24.11 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.22 
 
 		 531 aa  71.2  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  27.07 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  21.46 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  21.4 
 
 		 350 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  21.79 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  27.31 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  22.94 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  25.21 
 
 		 368 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.93 
 
 		 346 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  28.26 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  26.27 
 
 		 346 aa  66.6  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  19.31 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  25.5 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  21.88 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  21.88 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  21.88 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  21.88 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  21.88 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  25.89 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  25.39 
 
 		 341 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  25.35 
 
 		 351 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  22.99 
 
 		 325 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  22.75 
 
 		 336 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  26.72 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  19.62 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.88 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  20.98 
 
 		 330 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.41 
 
 		 351 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.41 
 
 		 351 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  20.54 
 
 		 330 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  29 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.41 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  25.11 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  22.22 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  23.55 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  20.67 
 
 		 346 aa  60.1  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  27.7 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  21.51 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  26.84 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  26.54 
 
 		 388 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  27.69 
 
 		 565 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  23.14 
 
 		 332 aa  57  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  24.47 
 
 		 366 aa  56.2  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  23.69 
 
 		 350 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.57 
 
 		 350 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  23.14 
 
 		 332 aa  56.2  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  22.67 
 
 		 371 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  22.73 
 
 		 335 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  22.15 
 
 		 359 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  23.04 
 
 		 359 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  22.31 
 
 		 335 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  28.4 
 
 		 551 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  24.53 
 
 		 395 aa  53.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  22.57 
 
 		 359 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  32.98 
 
 		 569 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  22.57 
 
 		 359 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  22.57 
 
 		 359 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  21.49 
 
 		 335 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  32.81 
 
 		 569 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  21.97 
 
 		 509 aa  51.6  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  24.8 
 
 		 359 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  34 
 
 		 565 aa  50.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  22.68 
 
 		 671 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  30 
 
 		 541 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  24.21 
 
 		 335 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  21.88 
 
 		 324 aa  50.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  28.23 
 
 		 564 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  29.68 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  30.25 
 
 		 605 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  26.97 
 
 		 459 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>