More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2225 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  584  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  48.5 
 
 		 304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  38.71 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  40.51 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  35.39 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 301 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  39.41 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 333 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  35.85 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  41.8 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  38.74 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  38.17 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 		 327 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 		 331 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  35.1 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  37.01 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  34.5 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  38.94 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  38.63 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  33.23 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  33.75 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  34.34 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3664  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  34.63 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  35.61 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 350 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1309  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 334 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  28 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.29 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.29 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.29 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  28.29 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.29 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.29 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.29 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.29 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.48 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>