272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2203 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
173 aa  330  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  47.27 
 
 
196 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  41.92 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  46.36 
 
 
160 aa  111  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  44.52 
 
 
205 aa  111  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  45.45 
 
 
203 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  46.67 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  44.03 
 
 
162 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  52.03 
 
 
166 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  44.38 
 
 
220 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  41.25 
 
 
220 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  39.49 
 
 
175 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  44.44 
 
 
222 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  43.48 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  41.25 
 
 
219 aa  99  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  46.04 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  43.14 
 
 
162 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  42.45 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  48.45 
 
 
190 aa  90.5  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  40.25 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  44.59 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  47.74 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  39.62 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  38.61 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  37.82 
 
 
159 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  40.41 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  40.41 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  40.41 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  38.79 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  47.47 
 
 
268 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  36.94 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  43.57 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  36.48 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06980  hypothetical protein  39.76 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.106451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  36.48 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  37.27 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  43.24 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  35.62 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  35.22 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  32.03 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  32.28 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  39.66 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  32.89 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  41.46 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  31.54 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  38.04 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  32.87 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  37.3 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  34.21 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  34.21 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  37.19 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  31.61 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  31.48 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  30.07 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  30.08 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  42.22 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  32.43 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  39.08 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  36.84 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  41.3 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  31.33 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  37.74 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  36.72 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  38.54 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  32.7 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  38.54 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  38.54 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  38.14 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  38.54 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  38.54 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  35.92 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  39.36 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  37.04 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  32 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  32.56 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  41.3 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  36.97 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  30.07 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  32.37 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  32.37 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  34.92 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  42.17 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  30.71 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  30.65 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>