More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2158 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
507 aa  960    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.4 
 
 
512 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.66 
 
 
497 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.64 
 
 
501 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.64 
 
 
501 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  48.81 
 
 
517 aa  347  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.25 
 
 
544 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.02 
 
 
497 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.98 
 
 
496 aa  319  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  45.36 
 
 
528 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.66 
 
 
523 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.86 
 
 
475 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.86 
 
 
475 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.86 
 
 
475 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1069  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.57 
 
 
497 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.14 
 
 
349 aa  258  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.52 
 
 
512 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.37 
 
 
569 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  46.19 
 
 
464 aa  240  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.15 
 
 
440 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.15 
 
 
440 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.15 
 
 
440 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.44 
 
 
487 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  53.25 
 
 
537 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  48.4 
 
 
597 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  50.47 
 
 
485 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  46.96 
 
 
423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.6 
 
 
579 aa  233  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.06 
 
 
558 aa  233  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  44.38 
 
 
584 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  44.16 
 
 
527 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.56 
 
 
674 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.4 
 
 
515 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  46.38 
 
 
443 aa  226  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.15 
 
 
545 aa  226  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.82 
 
 
640 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.53 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  45.51 
 
 
583 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.32 
 
 
515 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  47.37 
 
 
614 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.56 
 
 
916 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.13 
 
 
518 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.85 
 
 
420 aa  216  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  49.84 
 
 
575 aa  216  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.09 
 
 
439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.69 
 
 
524 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  45.6 
 
 
515 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.77 
 
 
417 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  43.2 
 
 
539 aa  211  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.66 
 
 
417 aa  210  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.76 
 
 
471 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  39.16 
 
 
489 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  41.56 
 
 
594 aa  207  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  41.11 
 
 
673 aa  207  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.71 
 
 
506 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.97 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2466  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.29 
 
 
556 aa  200  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.39 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.38 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.54 
 
 
434 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7403  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.83 
 
 
618 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.39 
 
 
545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0433  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.47 
 
 
471 aa  190  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000434978  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.41 
 
 
436 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  45.95 
 
 
552 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  41.84 
 
 
500 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  42.7 
 
 
476 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.31 
 
 
388 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  44.88 
 
 
502 aa  187  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  45.96 
 
 
469 aa  187  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  41.05 
 
 
393 aa  186  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.13 
 
 
379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  45.77 
 
 
379 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.64 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.99 
 
 
476 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  44.21 
 
 
502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  40.83 
 
 
411 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  44.6 
 
 
413 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.38 
 
 
381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  42.42 
 
 
395 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.51 
 
 
384 aa  183  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  42.11 
 
 
453 aa  183  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.41 
 
 
423 aa  183  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  42.34 
 
 
498 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.31 
 
 
483 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.66 
 
 
483 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  41.13 
 
 
514 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  44.6 
 
 
412 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  40.99 
 
 
505 aa  182  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.31 
 
 
483 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  36.46 
 
 
409 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  42.12 
 
 
487 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.86 
 
 
475 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  37.32 
 
 
518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  43.46 
 
 
511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.95 
 
 
467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  40.93 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  39.93 
 
 
487 aa  181  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  40.34 
 
 
459 aa  181  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  40.34 
 
 
459 aa  181  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>