More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2134 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 215 aa  225  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  55.45 
 
 		 216 aa  225  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  59.38 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 238 aa  217  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  52.66 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  58.46 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  52.76 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  52.55 
 
 		 216 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  46.48 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 206 aa  191  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  48.22 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  49.22 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  54.14 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  40.53 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  31.42 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  31.42 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  25.24 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  27.59 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  23.77 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  26.42 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  27.59 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>