More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2093 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2093  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 484 aa  966    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000338796  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29970  diaminopimelate decarboxylase  60.12 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.450757  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6157  diaminopimelate decarboxylase  63.67 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1900  diaminopimelate decarboxylase  58.9 
 
 		 473 aa  541  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3883  diaminopimelate decarboxylase  58.99 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29281  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3897  diaminopimelate decarboxylase  59.19 
 
 		 474 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3971  diaminopimelate decarboxylase  59.19 
 
 		 474 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3940  diaminopimelate decarboxylase  61.12 
 
 		 461 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4349  diaminopimelate decarboxylase  59.39 
 
 		 476 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.204157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2297  diaminopimelate decarboxylase  59.88 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11320  diaminopimelate decarboxylase lysA (dap decarboxylase)  60.26 
 
 		 447 aa  528  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2425  diaminopimelate decarboxylase  59.38 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.131973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1637  diaminopimelate decarboxylase  60.38 
 
 		 460 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00899819  normal  0.731678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0317  diaminopimelate decarboxylase  58.25 
 
 		 461 aa  522  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.241285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0878  diaminopimelate decarboxylase  58.71 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.109774  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1229  diaminopimelate decarboxylase  59.62 
 
 		 453 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1198  diaminopimelate decarboxylase  59.75 
 
 		 465 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4154  diaminopimelate decarboxylase  58.98 
 
 		 496 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.753034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4034  diaminopimelate decarboxylase  57.46 
 
 		 470 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  hitchhiker  0.00505776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3652  diaminopimelate decarboxylase  56.39 
 
 		 470 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1251  diaminopimelate decarboxylase  56.32 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254019  normal  0.196655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0629  diaminopimelate decarboxylase  56.63 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0587531  decreased coverage  0.000745702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5547  diaminopimelate decarboxylase  53.56 
 
 		 468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.208469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19350  diaminopimelate decarboxylase  52.45 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.28871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1743  diaminopimelate decarboxylase  55.99 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2357  diaminopimelate decarboxylase  48.25 
 
 		 490 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000765789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09810  diaminopimelate decarboxylase  51.94 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1053  diaminopimelate decarboxylase  52.68 
 
 		 458 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.861814  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2624  diaminopimelate decarboxylase  47.25 
 
 		 500 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.372196  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3726  diaminopimelate decarboxylase  52.57 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575274  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08010  diaminopimelate decarboxylase  49.59 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.426726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5579  diaminopimelate decarboxylase  53.22 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1792  diaminopimelate decarboxylase  49.23 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2466  diaminopimelate decarboxylase  50.32 
 
 		 463 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.093066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1280  diaminopimelate decarboxylase  50.88 
 
 		 455 aa  360  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199446  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  43.46 
 
 		 439 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1473  diaminopimelate decarboxylase  41.81 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  42.76 
 
 		 445 aa  347  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3871  diaminopimelate decarboxylase  42.04 
 
 		 438 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.063243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1579  diaminopimelate decarboxylase  42.04 
 
 		 438 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1542  diaminopimelate decarboxylase  41.81 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0382  diaminopimelate decarboxylase  45.19 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1302  diaminopimelate decarboxylase  41.59 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1303  diaminopimelate decarboxylase  41.59 
 
 		 438 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1329  diaminopimelate decarboxylase  41.59 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1438  diaminopimelate decarboxylase  41.59 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1510  diaminopimelate decarboxylase  41.59 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1342  diaminopimelate decarboxylase  42.04 
 
 		 438 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.369143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  42.18 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0612  diaminopimelate decarboxylase  43.89 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.239326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1303  diaminopimelate decarboxylase  44.77 
 
 		 435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1141  diaminopimelate decarboxylase  41.59 
 
 		 438 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3234  diaminopimelate decarboxylase  44.4 
 
 		 437 aa  336  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2086  diaminopimelate decarboxylase  40.82 
 
 		 447 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000557843  normal  0.888186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6754  diaminopimelate decarboxylase  48.22 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  43.08 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0576  diaminopimelate decarboxylase  40.36 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.757685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0562  diaminopimelate decarboxylase  40.36 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  40.27 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0279  diaminopimelate decarboxylase  44.42 
 
 		 451 aa  324  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  39.82 
 
 		 421 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  39.82 
 
 		 421 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  40.87 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  42.07 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  40.27 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  42.07 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  43.21 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  41.85 
 
 		 434 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0790  diaminopimelate decarboxylase  40.63 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0732  diaminopimelate decarboxylase  42.28 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1130  diaminopimelate decarboxylase  42.37 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.153124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0970  diaminopimelate decarboxylase  39.1 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0912  diaminopimelate decarboxylase  38.76 
 
 		 464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0262  diaminopimelate decarboxylase  40.08 
 
 		 464 aa  306  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1814  diaminopimelate decarboxylase  42.13 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.040954  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01670  diaminopimelate decarboxylase  43.33 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.209967  hitchhiker  0.000000000000581642 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0771  diaminopimelate decarboxylase  39.02 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.129495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  39.78 
 
 		 445 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0667  diaminopimelate decarboxylase  40.14 
 
 		 430 aa  300  5e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00422384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0123  diaminopimelate decarboxylase  38.83 
 
 		 474 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.251884  normal  0.0757404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0126  diaminopimelate decarboxylase  38.83 
 
 		 474 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1629  diaminopimelate decarboxylase  42.31 
 
 		 459 aa  293  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4736  diaminopimelate decarboxylase  37.86 
 
 		 463 aa  293  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.775184  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  38.01 
 
 		 435 aa  292  8e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2435  diaminopimelate decarboxylase  38.39 
 
 		 475 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.588454 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1101  diaminopimelate decarboxylase  36.88 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1034  diaminopimelate decarboxylase  39.02 
 
 		 448 aa  290  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3415  diaminopimelate decarboxylase  41.32 
 
 		 444 aa  287  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.0355245 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11811  diaminopimelate decarboxylase  37.16 
 
 		 457 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1391  diaminopimelate decarboxylase  40.7 
 
 		 459 aa  282  9e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09931  diaminopimelate decarboxylase  41.23 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11971  diaminopimelate decarboxylase  36.23 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11961  diaminopimelate decarboxylase  35.79 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0842  diaminopimelate decarboxylase  36.01 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0309438 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10961  diaminopimelate decarboxylase  39.44 
 
 		 455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297348  normal  0.231621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4702  diaminopimelate decarboxylase  38.36 
 
 		 458 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14901  diaminopimelate decarboxylase  35.16 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.813083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1791  diaminopimelate decarboxylase  40.67 
 
 		 423 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0658  diaminopimelate decarboxylase  34.73 
 
 		 454 aa  263  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  35.57 
 
 		 430 aa  261  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>