191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2052 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 429 aa  815    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  51.49 
 
 		 413 aa  328  9e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  48.66 
 
 		 386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  51.67 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  45.65 
 
 		 414 aa  299  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  49.6 
 
 		 392 aa  298  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  47.64 
 
 		 393 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  50.52 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  47.37 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  45.79 
 
 		 429 aa  288  9e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  49.07 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  49.87 
 
 		 408 aa  285  9e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  43.7 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  51.32 
 
 		 473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  46.61 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  49.74 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 408 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 403 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.56 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  46.34 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  46.29 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  46.29 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  46.29 
 
 		 428 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  44.96 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  50.9 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  46.82 
 
 		 420 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  49.47 
 
 		 384 aa  270  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  44.09 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  45.89 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  47.86 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  42.55 
 
 		 539 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  47.62 
 
 		 373 aa  246  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  43.57 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  52.43 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  50.93 
 
 		 276 aa  89.7  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  43.88 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  33.47 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  46.24 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  41.58 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  29.35 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  47.54 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  29.96 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  24.87 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  37.21 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  24.87 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  31.82 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  38.1 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  40.3 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  23.59 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  44.26 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  33.95 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  39.42 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  31.53 
 
 		 648 aa  57.4  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  29 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 429 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 429 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 429 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  24.87 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  34 
 
 		 553 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  28 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  37.62 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  32.57 
 
 		 246 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  47.3 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  27.59 
 
 		 371 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  27 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 494 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  39.62 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  39.18 
 
 		 389 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  31.6 
 
 		 614 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  39.74 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  52 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  32.82 
 
 		 547 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  39.77 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.32 
 
 		 480 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  39.62 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  40.62 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 558 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  47.73 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  29.39 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  36.47 
 
 		 528 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  31.39 
 
 		 647 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  42.47 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  46.94 
 
 		 486 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  38.33 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  39.01 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  39.22 
 
 		 362 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.33 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 493 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>