21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2049 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1482 bp  1798    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1488 bp  1798    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3628    97.1 
 
 		 4277 bp  2476    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0797695  decreased coverage  0.00230701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2049    100 
 
 		 2995 bp  5937    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0144762  decreased coverage  0.00465483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    99.27 
 
 		 2389 bp  2902    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1482 bp  1798    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1283    100 
 
 		 4742 bp  1798    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430984  normal  0.62952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  91.03 
 
 		 1470 bp  1063    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3888    85.6 
 
 		 2845 bp  204  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0687901  normal  0.0695799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1589    84.55 
 
 		 2527 bp  176  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3424    86.23 
 
 		 2811 bp  123  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212829  normal  0.19279 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  79.63 
 
 		 1569 bp  119  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  78.5 
 
 		 1533 bp  109  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  79.58 
 
 		 1500 bp  105  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  79.58 
 
 		 1500 bp  105  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  79.58 
 
 		 1500 bp  105  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  79.58 
 
 		 1500 bp  105  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0554    79.58 
 
 		 1167 bp  105  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  94.44 
 
 		 1410 bp  56  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  94.29 
 
 		 1785 bp  54  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  94.29 
 
 		 1932 bp  54  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>