176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2047 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2072    98.94 
 
 
1246 bp  1778    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0667112  normal  0.0247017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3679    98.72 
 
 
1246 bp  1762    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119841  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  97.05 
 
 
1389 bp  2375    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3471    96.57 
 
 
3127 bp  2597    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157183  hitchhiker  0.00172393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  97.05 
 
 
1389 bp  2375    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  99.26 
 
 
1245 bp  1808    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  97.05 
 
 
1389 bp  2375    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3557    98.72 
 
 
1246 bp  1762    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000455542  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3734    95.13 
 
 
2860 bp  1247    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.222012  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    96.5 
 
 
3175 bp  2593    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  97.05 
 
 
1389 bp  2375    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  100 
 
 
1380 bp  2736    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  97.2 
 
 
1389 bp  2391    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  94.96 
 
 
1248 bp  1382    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  99.2 
 
 
1380 bp  2648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  94.96 
 
 
1248 bp  1382    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    100 
 
 
6126 bp  12140    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3746    98.94 
 
 
1246 bp  1778    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.13138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3693    98.94 
 
 
1246 bp  1778    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000194072  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1456    89.14 
 
 
375 bp  341  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.85037  normal  0.451915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  80.2 
 
 
1248 bp  285  7e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  80.2 
 
 
1248 bp  285  7e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  80.2 
 
 
1248 bp  285  7e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  80.2 
 
 
1311 bp  285  7e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  80.06 
 
 
1248 bp  278  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0401    94.19 
 
 
234 bp  262  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  79.64 
 
 
1236 bp  250  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  88.13 
 
 
1260 bp  228  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  88.13 
 
 
1260 bp  228  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  88.13 
 
 
1260 bp  228  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  78.42 
 
 
1287 bp  210  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  78.42 
 
 
1287 bp  210  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  78.42 
 
 
1287 bp  210  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  87.56 
 
 
1287 bp  208  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  79.85 
 
 
1350 bp  206  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    79.85 
 
 
3818 bp  206  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  85.6 
 
 
1368 bp  204  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  85.6 
 
 
1368 bp  204  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  85.6 
 
 
1368 bp  204  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  79.66 
 
 
1350 bp  198  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  79.48 
 
 
1350 bp  190  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    79.48 
 
 
2767 bp  190  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  79.48 
 
 
1350 bp  190  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  79.29 
 
 
1350 bp  182  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3665    85.58 
 
 
432 bp  180  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  84.55 
 
 
1389 bp  176  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  84.55 
 
 
1389 bp  176  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1742    84.55 
 
 
2735 bp  176  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  84.55 
 
 
1389 bp  176  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  84.55 
 
 
1389 bp  176  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  88.33 
 
 
1248 bp  174  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  84.68 
 
 
1344 bp  170  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  84.68 
 
 
1344 bp  170  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  84.68 
 
 
1344 bp  170  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  84.12 
 
 
1389 bp  168  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2591    84.12 
 
 
2288 bp  168  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  84.23 
 
 
1344 bp  163  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  84.23 
 
 
1344 bp  163  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3587    92.24 
 
 
222 bp  159  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.028456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5496  transposase, mutator type  78.82 
 
 
1062 bp  155  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0512335 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4282    82.8 
 
 
1131 bp  155  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.921914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  85.47 
 
 
1248 bp  149  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3590  transposase, mutator type  83.18 
 
 
1113 bp  139  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12681  hypothetical protein  81.2 
 
 
804 bp  131  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.001544  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09270  transposase  83.98 
 
 
1248 bp  129  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.681335  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06560  transposase  83.98 
 
 
1248 bp  129  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.796022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17620  transposase  83.98 
 
 
1248 bp  129  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0181204  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1371  transposase, mutator type  83.6 
 
 
450 bp  129  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  83.6 
 
 
1242 bp  129  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  83.6 
 
 
1242 bp  129  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  86.23 
 
 
1356 bp  123  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  86.23 
 
 
1356 bp  123  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25910  transposase  81.66 
 
 
1251 bp  121  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1368  transposase mutator type  82.74 
 
 
1623 bp  121  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2881    82.74 
 
 
783 bp  121  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  81.06 
 
 
1251 bp  109  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  81.06 
 
 
1251 bp  109  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25830  transposase  81.06 
 
 
1251 bp  109  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2875  hypothetical protein  85.04 
 
 
369 bp  101  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.302821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  87.13 
 
 
1254 bp  97.6  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20580    87.13 
 
 
2258 bp  97.6  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>