147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1959 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  39.68 
 
 		 1176 aa  645    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  40.46 
 
 		 1184 aa  689    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  100 
 
 		 1231 aa  2446    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  40.84 
 
 		 1174 aa  708    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  41.18 
 
 		 1175 aa  669    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  36.08 
 
 		 1623 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  33.2 
 
 		 1386 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  34.99 
 
 		 1797 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  34.82 
 
 		 1836 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  36.73 
 
 		 2090 aa  351  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  32.56 
 
 		 1976 aa  349  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  32.95 
 
 		 1955 aa  347  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  31.84 
 
 		 1980 aa  346  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  32.06 
 
 		 1967 aa  346  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  32.79 
 
 		 1952 aa  340  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  33.97 
 
 		 1523 aa  336  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  33.97 
 
 		 1523 aa  336  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  33.82 
 
 		 1529 aa  332  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  31 
 
 		 957 aa  273  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4256  TrwC relaxase  30.72 
 
 		 1026 aa  272  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  31.18 
 
 		 945 aa  213  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  29.55 
 
 		 944 aa  201  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  28.46 
 
 		 1035 aa  155  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  28.3 
 
 		 907 aa  152  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08050  TrwC relaxase  27.02 
 
 		 1160 aa  144  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  27.08 
 
 		 961 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  30.73 
 
 		 952 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  29.62 
 
 		 952 aa  138  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  29.76 
 
 		 872 aa  131  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  30.54 
 
 		 946 aa  128  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.9 
 
 		 1098 aa  127  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.08 
 
 		 1098 aa  127  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  28.5 
 
 		 866 aa  127  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  31.78 
 
 		 1006 aa  126  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  29.33 
 
 		 1107 aa  126  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1453  TrwC relaxase  29.51 
 
 		 1223 aa  125  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  32.39 
 
 		 379 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  30.88 
 
 		 982 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  29.12 
 
 		 976 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  29.12 
 
 		 976 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  30.98 
 
 		 998 aa  122  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  29.87 
 
 		 968 aa  121  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  29.91 
 
 		 1000 aa  121  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  29.91 
 
 		 1000 aa  121  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  29.96 
 
 		 985 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.14 
 
 		 1095 aa  119  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  29.92 
 
 		 1025 aa  119  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  29.98 
 
 		 1107 aa  119  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  29.9 
 
 		 1034 aa  118  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  29.17 
 
 		 1039 aa  118  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  28.99 
 
 		 974 aa  118  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  31.37 
 
 		 1034 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  28.78 
 
 		 1102 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0016  TrwC relaxase  27.85 
 
 		 926 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  28.54 
 
 		 1102 aa  115  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2022  TrwC relaxase  28.98 
 
 		 1112 aa  115  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.91 
 
 		 1536 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  29.39 
 
 		 1100 aa  112  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.47 
 
 		 1356 aa  112  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  29.03 
 
 		 998 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  20.41 
 
 		 1112 aa  109  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0858  TrwC relaxase  33.56 
 
 		 1208 aa  109  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.08 
 
 		 1102 aa  109  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  24.89 
 
 		 964 aa  108  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  28.57 
 
 		 1557 aa  107  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.07 
 
 		 1245 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  26.92 
 
 		 1665 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  29.21 
 
 		 1093 aa  106  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  29.47 
 
 		 1100 aa  105  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.68 
 
 		 1534 aa  104  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  27.95 
 
 		 881 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  29.53 
 
 		 1123 aa  103  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.07 
 
 		 1105 aa  103  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  27.71 
 
 		 879 aa  103  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  30.27 
 
 		 936 aa  102  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.29 
 
 		 1538 aa  102  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  27.4 
 
 		 1014 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  28.45 
 
 		 814 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  26.69 
 
 		 1010 aa  94  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  29.5 
 
 		 1486 aa  92.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  34.46 
 
 		 1111 aa  86.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  30.18 
 
 		 923 aa  86.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  35.88 
 
 		 322 aa  84.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  31.62 
 
 		 1170 aa  82.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  31.11 
 
 		 943 aa  80.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  32.18 
 
 		 1683 aa  79.3  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3619  exonuclease V subunit alpha  36.96 
 
 		 1082 aa  79  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  28.32 
 
 		 1351 aa  78.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3226  aldehyde dehydrogenase  31.19 
 
 		 1681 aa  77.4  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  34.08 
 
 		 981 aa  77.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  28.06 
 
 		 1549 aa  77.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  29.19 
 
 		 910 aa  76.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  26.51 
 
 		 1168 aa  75.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  25.8 
 
 		 918 aa  75.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  25.54 
 
 		 926 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1013 aa  73.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  30.63 
 
 		 1189 aa  72.4  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  33.15 
 
 		 982 aa  70.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  29.02 
 
 		 542 aa  71.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3338  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1520 aa  70.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.389694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>