227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1911 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  100 
 
 
990 aa  1910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  52.76 
 
 
881 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  39.46 
 
 
1102 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  38.45 
 
 
925 aa  161  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.33 
 
 
1019 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.28 
 
 
876 aa  142  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.61 
 
 
867 aa  141  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  31.9 
 
 
913 aa  138  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.94 
 
 
897 aa  137  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.92 
 
 
901 aa  135  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.67 
 
 
922 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  30 
 
 
916 aa  130  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.13 
 
 
910 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.16 
 
 
766 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
914 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  32.33 
 
 
899 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.81 
 
 
870 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.09 
 
 
846 aa  127  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.43 
 
 
921 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.22 
 
 
905 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  31.75 
 
 
900 aa  126  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.54 
 
 
921 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.54 
 
 
921 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.73 
 
 
1021 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
921 aa  125  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  30.29 
 
 
913 aa  124  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30 
 
 
877 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  31.31 
 
 
905 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  27.7 
 
 
901 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  27.7 
 
 
901 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.7 
 
 
901 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
905 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  27.7 
 
 
901 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  27.7 
 
 
901 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  27.7 
 
 
901 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  27.7 
 
 
901 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  27.7 
 
 
901 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  31.07 
 
 
896 aa  120  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  32.87 
 
 
749 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  33.9 
 
 
917 aa  118  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  27.99 
 
 
901 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.92 
 
 
1003 aa  117  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  27.99 
 
 
902 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  31.4 
 
 
914 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  28.57 
 
 
901 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  28.57 
 
 
901 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.38 
 
 
933 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  28.57 
 
 
901 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.31 
 
 
905 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  28.28 
 
 
903 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  28.28 
 
 
903 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  29.45 
 
 
904 aa  115  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.64 
 
 
880 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  29.98 
 
 
1110 aa  116  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  26.04 
 
 
887 aa  114  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  27.54 
 
 
901 aa  114  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.12 
 
 
911 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  32.36 
 
 
904 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.14 
 
 
930 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  28.5 
 
 
894 aa  112  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  30.75 
 
 
920 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.46 
 
 
924 aa  112  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  29.04 
 
 
906 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  29.26 
 
 
947 aa  111  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.39 
 
 
896 aa  111  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  29.56 
 
 
878 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  30.24 
 
 
910 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.67 
 
 
758 aa  108  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  34.91 
 
 
919 aa  108  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  29.04 
 
 
906 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  29.54 
 
 
921 aa  107  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.76 
 
 
913 aa  107  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.8 
 
 
905 aa  107  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.22 
 
 
896 aa  107  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0105  transcriptional regulator domain protein  29.25 
 
 
969 aa  105  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.08 
 
 
914 aa  105  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.41 
 
 
935 aa  104  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  30.03 
 
 
824 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  29.14 
 
 
1097 aa  101  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.85 
 
 
889 aa  101  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.55 
 
 
907 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  25.97 
 
 
907 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  29.94 
 
 
904 aa  100  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  30.35 
 
 
1204 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.1 
 
 
932 aa  98.6  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  24.85 
 
 
901 aa  97.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.39 
 
 
894 aa  96.3  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.75 
 
 
900 aa  95.9  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2887  transcriptional regulator domain protein  38.83 
 
 
997 aa  95.1  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0904649  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.53 
 
 
884 aa  95.1  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  27.15 
 
 
1111 aa  95.1  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  28.62 
 
 
1163 aa  93.6  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  25.78 
 
 
907 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 
907 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  29.18 
 
 
911 aa  89.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  29.89 
 
 
717 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27.91 
 
 
1108 aa  90.1  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  32.13 
 
 
1145 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.75 
 
 
925 aa  88.6  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  27.98 
 
 
1064 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>