24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1898 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1898  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131013  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0394  hypothetical protein  56.96 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  41.09 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  60 
 
 		 388 aa  74.7  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  60.38 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  58.49 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  57.41 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5111  hypothetical protein  57.14 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0927764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  48.28 
 
 		 352 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  55.56 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  53.7 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2313  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.17 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  53.7 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6887  hypothetical protein  37.08 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  51.85 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  50 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  51.92 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  46.43 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  60 
 
 		 643 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  46.43 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2281  hypothetical protein  32.22 
 
 		 406 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000928814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  44.26 
 
 		 358 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  31.96 
 
 		 373 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.57 
 
 		 561 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>