18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1886 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1886  Integrase catalytic region  100 
 
 
418 aa  859    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0003225  normal  0.0562744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0891  Integrase catalytic region  99.04 
 
 
418 aa  850    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12821  hypothetical protein  50.94 
 
 
384 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13149  hypothetical protein  74.49 
 
 
197 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.933816 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2588  integrase domain-containing protein  31.42 
 
 
400 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.288598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2415  integrase catalytic subunit  36.14 
 
 
410 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0189453  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6000  integrase catalytic region  33.81 
 
 
507 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.234482 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5048  integrase catalytic region  33.81 
 
 
507 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7430  integrase catalytic region  32.56 
 
 
532 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.794856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13148  hypothetical protein  66.96 
 
 
116 aa  159  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1053  Integrase catalytic region  31.55 
 
 
410 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3038  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391359  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1649  hypothetical protein  27.4 
 
 
251 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.502661  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2332  transposase  35.78 
 
 
124 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.758466  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12819  hypothetical protein  43.4 
 
 
143 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2527  integrase, catalytic region  27.11 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  28.4 
 
 
317 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1693  integrase catalytic subunit  52.5 
 
 
167 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>