35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1875 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  44.49 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  44.44 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  39.27 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  37.33 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  34.78 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  34.62 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  34.5 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  32.05 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  35.53 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  29.37 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  33.62 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  31.39 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  28.77 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  27.83 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  29.44 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  27.02 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  31.75 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  28.14 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  30.66 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  36.45 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  30.08 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  34.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  29.96 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  32.14 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  28.57 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  30.3 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  27.43 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  34.39 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  28.79 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  29.51 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  28.37 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  27.88 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  27.88 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>