More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1824 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 330 aa  651    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  50.79 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  42.9 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  43.43 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  40.33 
 
 		 454 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  38.69 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  43.45 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  42.16 
 
 		 442 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  43.35 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  40.13 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  40.33 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  39.2 
 
 		 327 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  39.2 
 
 		 327 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  39.2 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  42.45 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  39.05 
 
 		 337 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  39.93 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  37.59 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  40.58 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  41.77 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  40.89 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  42.03 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  53.85 
 
 		 221 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  41.29 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  33.09 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  52.31 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  41.26 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  38.74 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 550 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 		 821 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 822 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 822 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 822 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  34.08 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  39.46 
 
 		 858 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  34.83 
 
 		 837 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 		 282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  31.14 
 
 		 871 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  32.37 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  32.37 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  32.37 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  32.37 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  32.37 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  32.37 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 283 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 864 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  30.58 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  30.58 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  30.58 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 911 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 394 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 838 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  29.78 
 
 		 537 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 569 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  34.24 
 
 		 889 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 528 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 528 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 569 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  31.07 
 
 		 771 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  28.81 
 
 		 455 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  34.25 
 
 		 884 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  29.22 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 762 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 538 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  30.28 
 
 		 756 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 718 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 693 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 		 787 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 		 753 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 701 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 718 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  26.39 
 
 		 674 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  30 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 772 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  34.17 
 
 		 275 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 705 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 658 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>