270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1820 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
150 aa  308  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  48.98 
 
 
146 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  43.87 
 
 
146 aa  105  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
167 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 
132 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  41.35 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  36.55 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  41.27 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  39.35 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  39.13 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  37.09 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  36.57 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  33.54 
 
 
283 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  35.77 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  33.54 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  41.23 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  36.72 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  35.06 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  34.53 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  34.53 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  34.53 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  32.09 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  41.35 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  29.65 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  32.31 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  31.11 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  34.03 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  35.38 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  38.1 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  34.55 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  38.83 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.87 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  30.71 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  38.18 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  33.65 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  32.17 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  29.92 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  29.92 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  29.92 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  29.92 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  29.92 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  29.92 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  32.69 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.04 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.04 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  26.56 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.8 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  29.89 
 
 
213 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  34.07 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.42 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
156 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
138 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
136 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  33.33 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>