121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1813 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 
245 aa  493  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  72.02 
 
 
245 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  72.2 
 
 
261 aa  341  6e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  65.29 
 
 
288 aa  318  4e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  65.29 
 
 
288 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  65.29 
 
 
285 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  67.52 
 
 
234 aa  311  4e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  63.37 
 
 
244 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  64.46 
 
 
278 aa  308  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  62.4 
 
 
287 aa  303  2e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  63.49 
 
 
278 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  65.68 
 
 
238 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  61.57 
 
 
280 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  61.57 
 
 
280 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  61.57 
 
 
280 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  61.57 
 
 
280 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  62.81 
 
 
263 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  62.81 
 
 
263 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  61.57 
 
 
327 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  62.81 
 
 
279 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  61.57 
 
 
318 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  62.4 
 
 
263 aa  298  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  62.81 
 
 
263 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  55.97 
 
 
253 aa  248  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  51.69 
 
 
243 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  52.54 
 
 
243 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  52.17 
 
 
236 aa  235  5e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  52.12 
 
 
243 aa  233  1e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  53.07 
 
 
247 aa  232  4e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  50 
 
 
245 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  51.45 
 
 
247 aa  228  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  52.26 
 
 
243 aa  228  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  51.53 
 
 
232 aa  225  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.21 
 
 
244 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  49.59 
 
 
243 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.06 
 
 
245 aa  222  5e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  64.67 
 
 
205 aa  220  1e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.24 
 
 
247 aa  219  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.48 
 
 
247 aa  220  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  53.11 
 
 
258 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.25 
 
 
247 aa  215  6e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  49.58 
 
 
241 aa  214  1e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  47.03 
 
 
243 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  49.15 
 
 
243 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  50 
 
 
220 aa  171  8e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  50 
 
 
220 aa  171  8e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  50 
 
 
220 aa  171  8e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.95 
 
 
242 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  42.37 
 
 
242 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  42.37 
 
 
242 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.53 
 
 
242 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  43.64 
 
 
247 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  40.68 
 
 
242 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.22 
 
 
240 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  41.53 
 
 
240 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  45.34 
 
 
252 aa  153  3e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  42.8 
 
 
240 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  42.8 
 
 
240 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.8 
 
 
240 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  42.8 
 
 
242 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  39.92 
 
 
239 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.51 
 
 
256 aa  140  2e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  41.53 
 
 
258 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  36.97 
 
 
248 aa  128  7e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.13 
 
 
245 aa  128  8e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.13 
 
 
245 aa  128  8e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.27 
 
 
251 aa  127  2e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.5 
 
 
250 aa  127  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  34.18 
 
 
254 aa  121  1e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  35.71 
 
 
245 aa  121  1e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  34.87 
 
 
245 aa  120  2e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.76 
 
 
248 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  32.06 
 
 
279 aa  111  1e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  33.89 
 
 
249 aa  111  1e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  39.6 
 
 
218 aa  108  7e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  34.07 
 
 
229 aa  108  9e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  40.1 
 
 
220 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  34.05 
 
 
627 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  38.29 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  27.27 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.997842 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  33.02 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  26.8 
 
 
259 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.69 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.71 
 
 
250 aa  84.7  1e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.83 
 
 
226 aa  83.2  3e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  29.9 
 
 
250 aa  79.7  4e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.03 
 
 
250 aa  79.3  6e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  27.84 
 
 
252 aa  73.9  2e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.39 
 
 
247 aa  73.6  3e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  27.78 
 
 
246 aa  73.6  3e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  31.73 
 
 
212 aa  73.2  4e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.12 
 
 
262 aa  73.2  4e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  30.58 
 
 
251 aa  71.2  1e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  29.63 
 
 
219 aa  70.1  3e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.82 
 
 
245 aa  69.7  4e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  31.58 
 
 
213 aa  68.9  6e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  31.58 
 
 
252 aa  68.9  6e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  31.58 
 
 
213 aa  68.9  7e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  33.5 
 
 
246 aa  68.2  1e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  31.5 
 
 
252 aa  68.6  1e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>