13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1784 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1784  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000285856  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11920  hypothetical protein  63.8 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1148  hypothetical protein  69.07 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0784  hypothetical protein  66.49 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4049  hypothetical protein  65.13 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.715703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2584  hypothetical protein  64.52 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3596  hypothetical protein  60.1 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3669  hypothetical protein  60.1 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3601  hypothetical protein  60.1 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4196  hypothetical protein  64.71 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5535  hypothetical protein  54.3 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2212  hypothetical protein  47.37 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.960442  normal  0.272068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3946  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 428 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>