103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1755 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  99.78 
 
 		 456 aa  913    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 457 aa  917    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  37.53 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  37.53 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  37.96 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  37.96 
 
 		 467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  37.55 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  37.55 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  37.55 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  35.31 
 
 		 408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  32.73 
 
 		 442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  34.97 
 
 		 307 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  35.04 
 
 		 329 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  30.85 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  30.85 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  30.85 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  30.85 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  29.61 
 
 		 462 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  27.27 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  27.27 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  28.76 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  28.63 
 
 		 464 aa  96.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  41.01 
 
 		 191 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  22.35 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  22.35 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  22.35 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  22.35 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  22.35 
 
 		 484 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  22.35 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  30.34 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  23.36 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  23.36 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  23.36 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  23.36 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  23.36 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  23.36 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  23.14 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  29.95 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  29.95 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  29.95 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  27.79 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  21.01 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  21.23 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  26.89 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0310  hypothetical protein  21.48 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0334982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  22.68 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  22.68 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  24.04 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  23.23 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  24.04 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  23.81 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  23.81 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  23.65 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  23.65 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  23.65 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  23.65 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  21.43 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  21.43 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  21.38 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  21.43 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  21.43 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  21.43 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  21.43 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  22.3 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  21.32 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  21.12 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2716  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.909313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0257  transposase IS4 family protein  22.52 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0484  transposase IS4 family protein  22.52 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0487  transposase IS4 family protein  22.52 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0503  transposase IS4 family protein  22.52 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>