273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1733 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
213 aa  414  1e-115  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
197 aa  174  1e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 
220 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
228 aa  95.9  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  35.29 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
198 aa  88.2  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
211 aa  88.2  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 
185 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
205 aa  84.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
203 aa  82  5e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
209 aa  80.9  1e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
196 aa  80.5  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
200 aa  80.5  2e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
205 aa  77  2e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  30.41 
 
 
216 aa  75.9  4e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  29.44 
 
 
198 aa  75.5  6e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 
217 aa  74.3  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 
219 aa  74.3  1e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
235 aa  73.2  2e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
193 aa  72.4  4e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
193 aa  72.4  4e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
193 aa  72  5e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.95 
 
 
213 aa  71.2  1e-11  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 
194 aa  69.3  4e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 
210 aa  68.9  5e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
202 aa  67.8  1e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
218 aa  62  6e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
187 aa  60.1  3e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
187 aa  60.1  3e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
477 aa  58.9  5e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
477 aa  58.9  5e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
187 aa  58.2  1e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 
276 aa  56.2  3e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
216 aa  55.1  7e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
227 aa  55.1  8e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  28.49 
 
 
510 aa  54.7  1e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 
250 aa  53.5  2e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
238 aa  53.9  2e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 
225 aa  53.1  3e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 
250 aa  53.5  3e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  52.8  4e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 
187 aa  52.8  4e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
245 aa  52  7e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
244 aa  51.6  9e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 
190 aa  51.2  1e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 
189 aa  51.2  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
232 aa  51.2  1e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
240 aa  51.2  1e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
231 aa  51.2  1e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
239 aa  50.4  2e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 
199 aa  50.1  2e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
230 aa  50.4  2e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 
215 aa  50.4  2e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
204 aa  50.4  2e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
258 aa  49.7  3e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
220 aa  49.3  4e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
209 aa  49.7  4e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
205 aa  49.3  5e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
242 aa  49.3  5e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3370  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 
228 aa  48.5  6e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0063882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
202 aa  48.5  7e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 
201 aa  48.1  8e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 
201 aa  48.1  9e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  3.10562e-15 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
201 aa  48.1  9e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.94535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  28.46 
 
 
151 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 
192 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
210 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
225 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  41.38 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  43.14 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>