273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1733 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  35.29 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 185 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  29.44 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 477 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 477 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  28.49 
 
 		 510 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 244 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3370  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0063882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  28.46 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  43.14 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>