More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1708 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  67.82 
 
 		 269 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  70.59 
 
 		 305 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  63.67 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  64.26 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  67.32 
 
 		 285 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  62.99 
 
 		 288 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  59.29 
 
 		 309 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  63.04 
 
 		 320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  57.81 
 
 		 292 aa  332  4e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  57.81 
 
 		 318 aa  331  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  60.08 
 
 		 258 aa  328  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  60.57 
 
 		 256 aa  324  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  62.15 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  59.92 
 
 		 258 aa  318  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  58.1 
 
 		 359 aa  317  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  58.1 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  59.22 
 
 		 280 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  59.52 
 
 		 316 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  57.54 
 
 		 324 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  59.35 
 
 		 307 aa  314  9e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  59.58 
 
 		 308 aa  314  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  61.41 
 
 		 300 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  56.85 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  60.08 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  59.13 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  57.03 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  58.33 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  58.73 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  60.42 
 
 		 314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  58.33 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  58.33 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  57.14 
 
 		 324 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  60 
 
 		 304 aa  311  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  56.3 
 
 		 338 aa  311  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  60.42 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  55.21 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  53.49 
 
 		 280 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  55.38 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  57.72 
 
 		 305 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  55.3 
 
 		 322 aa  308  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  56.08 
 
 		 304 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  59.58 
 
 		 316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  56.25 
 
 		 316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  55.69 
 
 		 304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  55.69 
 
 		 301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  57.94 
 
 		 308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  57.94 
 
 		 308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  57.94 
 
 		 308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  57.32 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  59.4 
 
 		 297 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  57.32 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  55.91 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  57.54 
 
 		 308 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  54.51 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  56.79 
 
 		 308 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  61.83 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  56.73 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  55.69 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4120  protein of unknown function DUF344  56.91 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.794478  hitchhiker  0.00182923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  57.32 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  56.38 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  59.17 
 
 		 513 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  58.72 
 
 		 327 aa  301  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  53.1 
 
 		 280 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  58.3 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  55.51 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  56.1 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  58.23 
 
 		 336 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  53.94 
 
 		 273 aa  299  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1170  protein of unknown function DUF344  51.33 
 
 		 278 aa  298  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0866985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  58.3 
 
 		 318 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1564  hypothetical protein  53.1 
 
 		 279 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  58.3 
 
 		 310 aa  297  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  58.23 
 
 		 340 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  58.95 
 
 		 364 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  57.51 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  57.33 
 
 		 314 aa  295  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  57.45 
 
 		 296 aa  295  8e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  58.41 
 
 		 391 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  54.36 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  61.29 
 
 		 393 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  55.14 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  59.47 
 
 		 383 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  58.48 
 
 		 405 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  56.96 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  51.35 
 
 		 272 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  58.04 
 
 		 365 aa  291  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  57.08 
 
 		 357 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  54.96 
 
 		 280 aa  291  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  54.96 
 
 		 280 aa  291  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  57.08 
 
 		 298 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2307  hypothetical protein  55.7 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.127828 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  56.7 
 
 		 263 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  54.96 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  55.34 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  58.26 
 
 		 285 aa  289  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3502  hypothetical protein  52.17 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  59.03 
 
 		 281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  55.32 
 
 		 326 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>