293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1656 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 273 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  42.64 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  39.11 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.87 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.98 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  35.88 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  34.6 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.04 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.28 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  36.07 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  22.73 
 
 		 272 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  40.18 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  24.52 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  18.14 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  21.39 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  20.79 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  25.86 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  31.93 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  20.34 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  31.95 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  29.55 
 
 		 1340 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  24.05 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  33.75 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  23.26 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  23.3 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  21.36 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  30.51 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 349 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  23.43 
 
 		 268 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  27.5 
 
 		 1374 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  23.4 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.07 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  23.95 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3326  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  32.61 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6334  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  22.09 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7439  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 134 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  19.67 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  25.47 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  18.47 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>