More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1633 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  100 
 
 
264 aa  527  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  48.02 
 
 
252 aa  205  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  47.6 
 
 
248 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  46 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  46 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  45.38 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  45.63 
 
 
249 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  44.84 
 
 
253 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  45.24 
 
 
253 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  43.25 
 
 
253 aa  175  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  44.88 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 
269 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  37.55 
 
 
266 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  35.74 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
274 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  32.55 
 
 
270 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  33.47 
 
 
268 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
263 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4115  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  34.39 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  37.15 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2439  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
266 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  30.98 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  38.37 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  34.47 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.32 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  36.17 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  40 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.6 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  29.77 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.99 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0288  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  32.72 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  40.31 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.97 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  40 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  31.88 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  48 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  33.12 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.14 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.34 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2783  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.34 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  26.9 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2759  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.34 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  34.81 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  32.5 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.9 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.82 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.88 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.88 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  43.62 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.69 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
221 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  35.83 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
581 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  34.88 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  33.96 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
281 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.34 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.46 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  22.94 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.24 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.54 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.72 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.95 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0683  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.95 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  28.22 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2760  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.95 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>