More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1630 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 497 aa  964    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  56.06 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  44.4 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  46.55 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  37.37 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  40.69 
 
 		 479 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  40.69 
 
 		 479 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  45.27 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  38.93 
 
 		 484 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  38.37 
 
 		 467 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  40.98 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  40.04 
 
 		 497 aa  276  9e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  38.77 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  38.87 
 
 		 495 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  35.99 
 
 		 509 aa  269  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  39.86 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  37.87 
 
 		 516 aa  266  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  34.45 
 
 		 504 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  36.58 
 
 		 510 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  36.58 
 
 		 510 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 		 510 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  36.25 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  37.09 
 
 		 509 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  36.47 
 
 		 516 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  36.57 
 
 		 490 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  37.07 
 
 		 510 aa  247  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  41.32 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  40.84 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 		 527 aa  237  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  39.81 
 
 		 496 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  37.41 
 
 		 502 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  41.25 
 
 		 483 aa  229  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  34.32 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  36.16 
 
 		 485 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  32.99 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  33.91 
 
 		 493 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  34.09 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  32.06 
 
 		 487 aa  206  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  36.68 
 
 		 504 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  37.6 
 
 		 507 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 475 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 507 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  32.6 
 
 		 506 aa  93.2  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 502 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 502 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  32.43 
 
 		 489 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 501 aa  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  23.05 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 521 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 490 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  31.63 
 
 		 716 aa  77  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.63 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 516 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  24.5 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  27.2 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 513 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  27.2 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  23.91 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 487 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 492 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 492 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  25.81 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  25.81 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.11 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.56 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.68 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  26.03 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  31.25 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  23.24 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>