223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1616 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
204 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  51.71 
 
 
208 aa  191  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.29 
 
 
204 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  50 
 
 
221 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50 
 
 
221 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  50.74 
 
 
205 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  46.08 
 
 
204 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.02 
 
 
221 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.78 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  46.57 
 
 
215 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.81 
 
 
204 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  46.83 
 
 
217 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  46.83 
 
 
217 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  46.83 
 
 
217 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.12 
 
 
217 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.06 
 
 
212 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.18 
 
 
200 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.5 
 
 
201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  45.85 
 
 
214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  45.13 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.46 
 
 
221 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  41.95 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.81 
 
 
210 aa  151  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  42.49 
 
 
201 aa  144  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  42.54 
 
 
219 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.22 
 
 
219 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 
221 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  41.5 
 
 
208 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.45 
 
 
224 aa  138  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.7 
 
 
201 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.56 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.67 
 
 
179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.31 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  43.22 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  40.51 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.56 
 
 
204 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.34 
 
 
187 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.75 
 
 
180 aa  120  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  36.92 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  36.08 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.82 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.66 
 
 
200 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.95 
 
 
196 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.86 
 
 
189 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.63 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  38.79 
 
 
221 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
183 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
183 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.58 
 
 
199 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.44 
 
 
183 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
181 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  36.73 
 
 
199 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.08 
 
 
181 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.81 
 
 
181 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.84 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  36.22 
 
 
187 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  33.33 
 
 
181 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
182 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.82 
 
 
192 aa  98.6  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.46 
 
 
180 aa  98.2  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
178 aa  97.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  35.53 
 
 
183 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  34.03 
 
 
187 aa  94  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 
208 aa  94  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.02 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.67 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.73 
 
 
178 aa  91.3  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  32.94 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.44 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
183 aa  88.2  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.02 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  31.68 
 
 
192 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.62 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 
192 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.14 
 
 
186 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34.54 
 
 
178 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
189 aa  85.1  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.82 
 
 
180 aa  84.7  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  31.34 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  33.17 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.2 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  29.5 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  27.86 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.17 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1772  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.45 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.9 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  34.52 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.29 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 
188 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>