More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1602 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  100 
 
 		 607 aa  1201    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  42.47 
 
 		 597 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  54.52 
 
 		 338 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  31.8 
 
 		 378 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  31.8 
 
 		 378 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  31.8 
 
 		 378 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  31.8 
 
 		 378 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  31.8 
 
 		 378 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  31.8 
 
 		 378 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  31.8 
 
 		 378 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  31.8 
 
 		 378 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  31.8 
 
 		 378 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  35.76 
 
 		 400 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  35.26 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  35.26 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  35.26 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  35.26 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  35.26 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  35.24 
 
 		 389 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.05 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.05 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.05 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  35.05 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.05 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.05 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  35.22 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  35.22 
 
 		 383 aa  140  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  35.16 
 
 		 389 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  35.22 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  35.16 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  35.16 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  35.47 
 
 		 425 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  33.23 
 
 		 377 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  33.23 
 
 		 377 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  33.44 
 
 		 369 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  33.23 
 
 		 377 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  33.23 
 
 		 377 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  34.71 
 
 		 381 aa  138  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  32.93 
 
 		 377 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  33.12 
 
 		 369 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  36.01 
 
 		 391 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  36.01 
 
 		 391 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  36.01 
 
 		 391 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  31.06 
 
 		 380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1710  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1834  integrase catalytic subunit  30.59 
 
 		 387 aa  125  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0615  integrase catalytic subunit  34.53 
 
 		 307 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1842  integrase catalytic subunit  30.59 
 
 		 387 aa  124  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0460  hypothetical protein  35.63 
 
 		 293 aa  124  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28440  integrase family protein  32.98 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04580  integrase family protein  32.98 
 
 		 434 aa  122  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  32.57 
 
 		 407 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  32.57 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 385 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  33.22 
 
 		 402 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  33.22 
 
 		 402 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  33.22 
 
 		 402 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  33.22 
 
 		 402 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  34.74 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  28.53 
 
 		 327 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  28.53 
 
 		 327 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  31.87 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  31.56 
 
 		 382 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  31.69 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  31.35 
 
 		 314 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  31.35 
 
 		 314 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  31.35 
 
 		 314 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  31.35 
 
 		 314 aa  100  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  31.35 
 
 		 314 aa  100  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 324 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 324 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 324 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 324 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0692  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 391 aa  97.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  31.27 
 
 		 330 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  31.27 
 
 		 347 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  31.27 
 
 		 330 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  31.27 
 
 		 330 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  30.86 
 
 		 330 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  32.91 
 
 		 338 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  32.91 
 
 		 338 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  32.91 
 
 		 338 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  31.58 
 
 		 320 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  31.58 
 
 		 320 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  28.8 
 
 		 359 aa  93.6  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  31.58 
 
 		 320 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  32.8 
 
 		 339 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>