250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1571 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 340 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  63.82 
 
 		 340 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  64.01 
 
 		 341 aa  424  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.23 
 
 		 344 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  61.49 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  61.36 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  61.7 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.71 
 
 		 337 aa  388  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  60.3 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.82 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  59.53 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  60.29 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.95 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  60.29 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  60.29 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.46 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  58.65 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.11 
 
 		 340 aa  371  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.17 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  57.23 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.82 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  57.48 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  58.93 
 
 		 343 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  57.01 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  57.01 
 
 		 339 aa  345  8e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.69 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.84 
 
 		 339 aa  335  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.05 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.29 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.97 
 
 		 341 aa  329  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  54.3 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.27 
 
 		 346 aa  322  4e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  52.07 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.9 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.48 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.43 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.69 
 
 		 345 aa  248  9e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  43.18 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.65 
 
 		 347 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.64 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  38.01 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.98 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.26 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.8 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.65 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  29.65 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.09 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.56 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.41 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.6 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.03 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.46 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.78 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  30.36 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.3 
 
 		 343 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.92 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.41 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.64 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.14 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  30.09 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  27.38 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.97 
 
 		 348 aa  165  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  32.79 
 
 		 370 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.63 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.99 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.59 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  28.74 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  29.24 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  28.87 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.42 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.38 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.42 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  30.3 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  33.44 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  36 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  32.77 
 
 		 354 aa  156  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  33.54 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.85 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  31.93 
 
 		 343 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.96 
 
 		 373 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  28.11 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  28.27 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  28.11 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  28.27 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  28.27 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  28.27 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  28.27 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  28.27 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  28.27 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  32.53 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  32.46 
 
 		 352 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.19 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>