136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1559 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
312 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.39 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 
321 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 
352 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.75 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.45 
 
 
318 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
309 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
306 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
309 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
329 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.06 
 
 
304 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
300 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.65 
 
 
307 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.16 
 
 
329 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.16 
 
 
276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.65 
 
 
318 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
314 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
317 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
311 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
311 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.25 
 
 
324 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
311 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
332 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
328 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
307 aa  95.9  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
309 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  20.65 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
308 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  29.51 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.04 
 
 
321 aa  89.4  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.68 
 
 
311 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
340 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
338 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.87 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  35.71 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  35.71 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  35.71 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  35.71 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.29 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.12 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.12 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  31.29 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.95 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  25.69 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
337 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
327 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.52 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 
162 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
340 aa  56.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.27 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.27 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
281 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.27 
 
 
304 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
308 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  47.37 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  38.32 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 
304 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  26.77 
 
 
304 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>