76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1558 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 198 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  33.71 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  33.14 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  47.95 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  30.94 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  29.32 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  45.31 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  28.99 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  56.52 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 415 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  53.06 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  30.16 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  56.82 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  52.5 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 428 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 414 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 208 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 207 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 213 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>