More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1505 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  100 
 
 		 504 aa  998    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.16 
 
 		 488 aa  641    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  69.1 
 
 		 493 aa  617  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  70.34 
 
 		 488 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.22 
 
 		 486 aa  597  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  68.41 
 
 		 480 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  66.04 
 
 		 479 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.34 
 
 		 491 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  66.11 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  67.78 
 
 		 482 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  66.11 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  66.11 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.76 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.71 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  66.6 
 
 		 481 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  58.78 
 
 		 500 aa  538  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  66.17 
 
 		 481 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  60.51 
 
 		 541 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.75 
 
 		 517 aa  525  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  65.36 
 
 		 450 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.11 
 
 		 454 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.87 
 
 		 480 aa  525  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  62.69 
 
 		 519 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.42 
 
 		 503 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  60.25 
 
 		 513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  64.85 
 
 		 454 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  60.98 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  66.67 
 
 		 529 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11560  GTPase ObgE  64.08 
 
 		 500 aa  493  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.32436 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  59.91 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  65 
 
 		 450 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  58.16 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  59.61 
 
 		 516 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  58.21 
 
 		 515 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  62.42 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  56.12 
 
 		 509 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  52.64 
 
 		 563 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  52.13 
 
 		 560 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.91 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.85 
 
 		 464 aa  315  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.52 
 
 		 482 aa  313  6.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.66 
 
 		 425 aa  306  6e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.74 
 
 		 463 aa  306  6e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  43.85 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  42.17 
 
 		 427 aa  300  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  47.1 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  45.41 
 
 		 428 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  45.91 
 
 		 432 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.12 
 
 		 437 aa  296  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  44.01 
 
 		 435 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.42 
 
 		 464 aa  293  5e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  49.77 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  43.65 
 
 		 428 aa  292  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  43.35 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.56 
 
 		 426 aa  290  5.0000000000000004e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 338 aa  290  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  43.32 
 
 		 435 aa  290  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  38 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.06 
 
 		 435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  43.22 
 
 		 428 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.18 
 
 		 353 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  43.52 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  43.52 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  42.76 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  42.76 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  42.53 
 
 		 428 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  42.53 
 
 		 428 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  42.53 
 
 		 428 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  38.69 
 
 		 423 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  42.53 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  43.52 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  49.23 
 
 		 346 aa  280  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.68 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 354 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.58 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 354 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  42.86 
 
 		 427 aa  275  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  40.32 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  40.83 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  40.83 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  40.68 
 
 		 439 aa  273  7e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.86 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  49.39 
 
 		 338 aa  270  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  50.77 
 
 		 338 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  46.54 
 
 		 439 aa  269  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  45.71 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.47 
 
 		 338 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  40.6 
 
 		 430 aa  267  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  44.65 
 
 		 424 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 338 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 338 aa  267  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.28 
 
 		 434 aa  266  8.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.21 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  41.71 
 
 		 428 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  41.71 
 
 		 428 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.95 
 
 		 429 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.95 
 
 		 438 aa  262  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.21 
 
 		 387 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.87 
 
 		 369 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>