More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1498 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 136 aa  270  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  79.41 
 
 		 136 aa  224  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  81.62 
 
 		 138 aa  223  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  78.68 
 
 		 136 aa  219  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  77.94 
 
 		 136 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  76.3 
 
 		 136 aa  218  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  75.74 
 
 		 136 aa  215  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  75.56 
 
 		 136 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  76.3 
 
 		 149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  76.3 
 
 		 149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  76.3 
 
 		 149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  69.29 
 
 		 140 aa  184  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  67.16 
 
 		 136 aa  183  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  66.18 
 
 		 136 aa  183  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  69.4 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  68.15 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  65.67 
 
 		 135 aa  178  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  66.42 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  67.16 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3490  Nucleoside-diphosphate kinase  63.31 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3466  nucleoside diphosphate kinase  63.97 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  65.91 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2558  Nucleoside-diphosphate kinase  62.59 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.927598  normal  0.152137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  63.16 
 
 		 135 aa  164  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1158  Nucleoside-diphosphate kinase  59.42 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0976  Nucleoside-diphosphate kinase  57.55 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1461  Nucleoside-diphosphate kinase  60.14 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0805889  normal  0.284135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09190  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.513672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  56.82 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  54.96 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  55.97 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 		 139 aa  149  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 149 aa  149  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 149 aa  149  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  54.2 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  58.73 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  52.63 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23840  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.882593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  53.44 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2149  Nucleoside-diphosphate kinase  56.62 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2228  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0390683  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0765  Nucleoside-diphosphate kinase  58.65 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0463345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  51.91 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09920  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 		 141 aa  143  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  56.3 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2395  nucleoside diphosphate kinase  56.3 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0825331  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  49.62 
 
 		 149 aa  141  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  51.91 
 
 		 149 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  52.27 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3326  nucleoside-diphosphate kinase  51.91 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10080  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187538  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  52.27 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0526  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06060  nucleoside diphosphate kinase  55.97 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.678172  hitchhiker  0.00000000266353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3489  nucleoside diphosphate kinase  55.22 
 
 		 141 aa  139  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  48.09 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0907  nucleoside-diphosphate kinase  48.12 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  54.55 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 149 aa  137  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  47.33 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  53.44 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  50.38 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  45.11 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  48.48 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1286  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0670  nucleoside diphosphate kinase  48.09 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  48.85 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2227  nucleoside diphosphate kinase  49.25 
 
 		 143 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  48.12 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0905  nucleoside diphosphate kinase  44.12 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.244999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  49.25 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1390  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1939  nucleoside diphosphate kinase  49.25 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>