More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1488 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
305 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  63.46 
 
 
321 aa  328  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  54.49 
 
 
317 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  55.56 
 
 
318 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  56.31 
 
 
300 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  56.31 
 
 
322 aa  288  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  52.16 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  58.14 
 
 
317 aa  285  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  59.47 
 
 
317 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  48.53 
 
 
315 aa  254  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  44.34 
 
 
344 aa  248  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  44.31 
 
 
375 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  54.67 
 
 
328 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  54.79 
 
 
294 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  47.17 
 
 
330 aa  235  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  49.18 
 
 
333 aa  235  9e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  48.53 
 
 
322 aa  231  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  47.04 
 
 
314 aa  228  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  48.87 
 
 
329 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  46.89 
 
 
320 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  46.08 
 
 
332 aa  222  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  47.19 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  50.68 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  44.59 
 
 
341 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  50.17 
 
 
318 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  50.17 
 
 
318 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  50.17 
 
 
318 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  41.61 
 
 
355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  47.12 
 
 
341 aa  198  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  40.94 
 
 
323 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  39.54 
 
 
361 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  42.39 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  40.89 
 
 
372 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  36.63 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  39.06 
 
 
315 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.88 
 
 
327 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  33.66 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  39.6 
 
 
314 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  34.7 
 
 
323 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.67 
 
 
324 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  50.32 
 
 
370 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  36.5 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  40.2 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  29.9 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  37.07 
 
 
344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 
328 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.63 
 
 
329 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  29.11 
 
 
344 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  31.9 
 
 
355 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  38.61 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  32.5 
 
 
323 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  39.87 
 
 
321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  39.8 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  36.75 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.16 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  32.92 
 
 
356 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  33.85 
 
 
331 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  39.07 
 
 
322 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 
369 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  33.11 
 
 
318 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  38.74 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  35.95 
 
 
322 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  31.99 
 
 
354 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  32.4 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.47 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  39.13 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  39.07 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  38.74 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  33.03 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  30.61 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  30.56 
 
 
315 aa  133  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  31.31 
 
 
329 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  34.3 
 
 
333 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  31.31 
 
 
329 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  38.59 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3453  thiamine-phosphate kinase  35.11 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  30.99 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  37.5 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  30.41 
 
 
320 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  30.41 
 
 
320 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  31.58 
 
 
319 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  35.98 
 
 
338 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  35.22 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  31.44 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  35.51 
 
 
324 aa  129  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  31.8 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  33.43 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  37.41 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  34.67 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  32.36 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  25.57 
 
 
314 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  27.05 
 
 
272 aa  127  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  39.43 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  37.21 
 
 
319 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  35.29 
 
 
329 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  30.07 
 
 
325 aa  125  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  38.89 
 
 
333 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  38.89 
 
 
333 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>