91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1465 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
191 aa  373  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  37.4 
 
 
158 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  31.29 
 
 
158 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  39.32 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  39.32 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  39.32 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  39.32 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  39.32 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  33.08 
 
 
158 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  33.08 
 
 
158 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  37.61 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  36.15 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  37.61 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  32.89 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  37.86 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  39.45 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  31.17 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  39.58 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  27.59 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  30.95 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  26.21 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  30.23 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  29.08 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  26.28 
 
 
169 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  31.54 
 
 
165 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  31.91 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  29.03 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  31.71 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  31.71 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  24.85 
 
 
165 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  28.87 
 
 
174 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  31.15 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  27.92 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  30.84 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  30.84 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  30.84 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  29.59 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  25.76 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  31.52 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  29.11 
 
 
166 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  26.24 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  29.46 
 
 
167 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  32.22 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  27.5 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  31.76 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  26.87 
 
 
512 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.4 
 
 
549 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  29.11 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  26.92 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  28.18 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  31.43 
 
 
170 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  29.89 
 
 
160 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  25 
 
 
177 aa  45.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  26.14 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  27.98 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 
181 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  29.79 
 
 
174 aa  44.7  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  23.96 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  23.19 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  33.96 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  28.75 
 
 
514 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  30.88 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  30 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  30.67 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1762  hypothetical protein  23.66 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00888497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1491  membrane flanked domain-containing protein  23.66 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  26.47 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  24.21 
 
 
467 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  35.85 
 
 
242 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  28.8 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  31.52 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  27.15 
 
 
170 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  34.85 
 
 
494 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  30.84 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  30.49 
 
 
182 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  30.26 
 
 
541 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  25 
 
 
171 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  25.41 
 
 
203 aa  42  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  26.47 
 
 
177 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  27.62 
 
 
174 aa  41.2  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>