More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1451 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  100 
 
 
405 aa  811    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  49.38 
 
 
399 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  48.91 
 
 
402 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  47.88 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  43.46 
 
 
410 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  44.08 
 
 
396 aa  300  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  46.37 
 
 
410 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  40.65 
 
 
414 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  42.36 
 
 
408 aa  299  7e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  40.55 
 
 
414 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  39.39 
 
 
415 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  41.22 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  38.75 
 
 
415 aa  282  9e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  38.89 
 
 
414 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  42.36 
 
 
407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  39.39 
 
 
387 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  42.36 
 
 
407 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  42.36 
 
 
407 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.46 
 
 
402 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.65 
 
 
401 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  41.56 
 
 
390 aa  262  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  38.83 
 
 
407 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3536  cytochrome P450  42.14 
 
 
391 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00204069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.7 
 
 
405 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.94 
 
 
405 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  39.6 
 
 
393 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  39.85 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  40.34 
 
 
429 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  39.53 
 
 
400 aa  243  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  40.63 
 
 
423 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  39.2 
 
 
407 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.26 
 
 
412 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.59 
 
 
410 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  38.22 
 
 
417 aa  235  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.89 
 
 
419 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.75 
 
 
436 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  39.79 
 
 
402 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  39.86 
 
 
416 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.26 
 
 
410 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  36.36 
 
 
399 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.26 
 
 
411 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.59 
 
 
414 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  37.33 
 
 
409 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  35.77 
 
 
408 aa  226  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  38.26 
 
 
417 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.75 
 
 
411 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.22 
 
 
414 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  36.8 
 
 
413 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  35.44 
 
 
408 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.23 
 
 
426 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.02 
 
 
420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.59 
 
 
411 aa  222  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.1 
 
 
411 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.35 
 
 
411 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.35 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  35.24 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  38.25 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.1 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.84 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.1 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  33.91 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.11 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.35 
 
 
411 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  36.34 
 
 
406 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.86 
 
 
411 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  36.52 
 
 
417 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  39.45 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.61 
 
 
400 aa  219  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  36.41 
 
 
423 aa  219  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  37.11 
 
 
417 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  37.47 
 
 
406 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  31.22 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.22 
 
 
411 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  36.91 
 
 
408 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  39.95 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  34.47 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  34.47 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  34.3 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  35.11 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  34.47 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  36.68 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.27 
 
 
417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  36.7 
 
 
407 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  37.01 
 
 
422 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  34.67 
 
 
398 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  35.38 
 
 
405 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  34.25 
 
 
401 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.87 
 
 
412 aa  209  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  40.56 
 
 
402 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  39.15 
 
 
423 aa  209  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  34.3 
 
 
412 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  38.28 
 
 
427 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  36.61 
 
 
404 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.22 
 
 
392 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  38.05 
 
 
401 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.49 
 
 
388 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.85 
 
 
400 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  37.3 
 
 
406 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  33.01 
 
 
414 aa  206  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  35.68 
 
 
409 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>