21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1385 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  100 
 
 
627 aa  1268    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.78 
 
 
755 aa  591  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  53.58 
 
 
640 aa  592  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  59.25 
 
 
562 aa  588  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  52.23 
 
 
645 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.5 
 
 
940 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  51.83 
 
 
850 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  51.02 
 
 
844 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  50.08 
 
 
640 aa  540  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.19 
 
 
962 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  47.39 
 
 
622 aa  511  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  47.74 
 
 
652 aa  511  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.35 
 
 
734 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  46.62 
 
 
918 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.55 
 
 
722 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  45.25 
 
 
732 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.26 
 
 
648 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  41.23 
 
 
2117 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.7 
 
 
537 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  35.12 
 
 
726 aa  290  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  37.28 
 
 
722 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>