More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1361 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.26 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  59.57 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  61.54 
 
 		 239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  53.71 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.89 
 
 		 242 aa  201  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  53.71 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  53.71 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  53.71 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  53.39 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  52 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  53.67 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.37 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.53 
 
 		 276 aa  184  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  46.88 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  52.61 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  54.38 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.34 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  51.61 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  52.29 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  47.47 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  47.75 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  43.6 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  47 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  47 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  45.74 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  48.42 
 
 		 332 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 		 235 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  36.44 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  39.24 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  38.53 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.64 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 244 aa  98.2  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  34.27 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.526934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 285 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  40.11 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 317 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 		 273 aa  93.2  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 300 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 268 aa  91.7  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  34.89 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  34.87 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 268 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 284 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0912  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 314 aa  89.4  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1588  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0248  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 299 aa  89  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1964  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1983  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00829881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  38.29 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1148  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 		 264 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382657  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  32.54 
 
 		 272 aa  88.6  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 		 249 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 269 aa  88.2  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0401  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  40.38 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0616963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>