More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1343 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 293 aa  607  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  60.28 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  59.93 
 
 		 287 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  59.93 
 
 		 287 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  59.93 
 
 		 287 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  58.51 
 
 		 288 aa  361  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  57.8 
 
 		 295 aa  353  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  42.61 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  40.21 
 
 		 287 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  35.93 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  33.55 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.2 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.19 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  31.28 
 
 		 286 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  30.86 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.12 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 286 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.2 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  27.55 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.62 
 
 		 367 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  30.65 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.62 
 
 		 370 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.18 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 345 aa  92  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  29.65 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.45 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 288 aa  89.7  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 283 aa  89  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 		 261 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.01 
 
 		 371 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.01 
 
 		 371 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>